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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 在线临床药理学体现草酸钙肾结石脱色应激性和细菌感染磨损规则

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿程序常用见的疾病症状之六。肾组织安排中CaOx单晶体过饱和状态基性岩会会出现肾小管人体细胞神经损伤和凋亡,因而会出现肾结石的出现。短链多余脂肪堆积酸由肠管内生物滤池细菌和病毒沤肥营养膳食玻纤导致,一方面在部位肠管防御系统性中引领使用,而是在程序能力上也引领主要使用。当中,丁酸是最雄厚的短链多余脂肪堆积酸,具备着抗感染和免疫系统调控使用,本理论研究讨论丁酸对CaOx肾结石的使用以及隐藏的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山醫院泌尿整形科吴忠传授、周子健搏士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠院士、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网络数据临床药理学服务保障,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章名字:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 雇主行业:华山医院医生 调查对方:大鼠、HK-2血细胞 组群数据:对比组(Con)、三维模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱保证技木:系统药学学查测

构思流量图

研究探讨报告单

实验探讨者先是构造 大鼠型号,采用身体生物化统计指标和组织安排病理学学染料等实验探讨途径察觉到丁酸都可以降低CaOx型号大鼠肾CaOx晶状体的构成和破损,改善效果CaOx型号大鼠的炎症病变破损和防氧化反应产物的过多表述。前者,丁酸还可促使草酸介导的HK-2血细胞膜破损、防氧化反应应激性和血细胞膜凋亡。 为科学研究性丁酸空间架构和靶人类表观遗传无线网上,科学研究技术人员从PubChem得到丁酸和丁酸酯的二维和3d空间架构(图1A)。实现PharmMapper参数库和Uniprot参数库处理后共挑选出114个丁酸靶人类表观遗传供进每一步具体具体阐述。将人类表观遗传列表框接入STRING参数库,使用PPI无线网上具体具体阐述。Cytoscape已给出了重新排列的前20的核心区靶人类表观遗传的图解无线网上图,还有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。等核心区人类表观遗传与无线网上中的其他人类表观遗传均症状出必要的涉及到性,解释等人类表观遗传已经性充分利用着携手能力。GO和KEGG具体具体阐述揭露了丁酸核心区人类表观遗传的涉及到渠道和分子生物技术学学技能(图1C)。核心区人类表观遗传通常与类固醇肾上腺素初次回应、腐蚀应激状态不起能力初次回应、抗逆性氧受损细胞对类固醇肾上腺素激起的不起能力及对弱酸性普通机械有机化合物的不起能力有观。总而言之所论,等核心区人类表观遗传通常参与活动了腐蚀应激状态不起能力和对抗逆性氧的分子生物技术学不起能力的过程,是肾结石出现缘由中至关注重的渠道,这表面丁酸已经性在肾结石中充分利用注重能力。

图1| 丁酸形式与靶人类基因网络上剖析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为深入一个脚印宇宙探索丁酸对CaOx肾结石.切靶dna组,学习方案人士巧用GEO大数据显示表对GSE73680中绿色比与CaOx肾结石用户的dna组区别做好了学习方案。比组与CaOx结石用户的有关于的系数性区别展示dna组(DEGs)检测的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna组发生了有关于的系数发生改变,在其中3379个(89.4%)dna组展示上浮,404个(10.6%)dna组展示上涨(图2A)。对DEGs做好聚类分析法剖析法剖析,热图表示了前10个被选中DEGs的二维分层次聚类分析法剖析法优点(图2B)。其次,学习方案人士能够GeneCards大数据显示表手动检验了370个已经与CaOx肾结石有关于的的dna组,的排名前20位的预测分析dna组下列关于有关于的性计分右图2C表达。只为寻到丁酸诊治CaOx肾结石的关健靶点,学习方案人士将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关于的dna组除理的半个个Venn图。终究,CYP2C9被明确为丁酸印象CaOx肾结石的潜在的靶点(图2D)。另外,学习方案人士还做好了丁酸与CYP2C9的原子核合作,CYP2C9的5个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸彼此能力,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在灵活运用网上药学学預測CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶表观遗传后,分析人士还经过体细胞系测试得知了CYP2C9可减轻草酸促进的HK-2体细胞系的ROS情况、支原体感染问题和凋亡。

图2| 大多据库合作概述預測CYP2C9是丁酸的功效于CaOx肾结石的靶基因遗传

研究分析最终结果

本科研应先出现 丁酸在离体和胃中均能促使CaOx肾结石绘图的被空气氧化应激性状态和发炎直接破损,己经完成网洛药剂学学学淘汰有丁酸关系CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,后来完成血神经元实验英文灵魂存在CYP2C9在草酸盐促进的HK-2血神经元ROS层次、发炎直接破损和凋亡。以上出现 发现丁酸有机会完成促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的被空气氧化应激性状态,解决发炎直接破损。这样历程中拜谱微生物体供给了网洛药剂学学学技術售后服务保障,不但拜谱微生物体可提升较为成熟逐步完善的染色体组学、球营养物质组学、分解组学等几组学產品及技術售后服务保障,热情接待拨通咨询公司! 分类文献资料:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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