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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

一直都在对于纸业主料而被了解一下的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废弃物”称得上“宝物小团伙”的苦不堪言以来类同,是直到近几十年才被得知其关键的菌物学的功能,从此以后“翻盘农奴把大合唱”,很大是在免疫抗体支原体感染性疾患研究方案研究方向内熠熠生辉。不存在篇论文范文媒体报道了在几种支原体感染性疾患的哺乳动物模特中带来衣康酸或其催化呈现衍菌物的诊疗益处,并得知其自身靶点。光于衣康酸的“上辈子”与“今世”,具体情况见文章《乳酸的逆襲兄弟姐妹——衣康酸!这篇跟大家了解一下衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用绘制球蛋白组学产品,实现1000+举重若轻度淡化位点检测,安稳复现精品靶点,全方面生信探讨解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“遇到”到“效验”全流程步骤售后服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、进行实验步奏

02、亲测参数

03、经“点”再现

在测评动态数据中,检测出另1个医学文献中新闻报道的经典之作靶点下列不属于衣康酸突显位点,如一号个被出现 的衣康酸共价突显核淀粉酶KEAP1,和糖酵解环路中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或是炎性小体分解成核淀粉酶NLRP3和神经元萎缩整个过程中的要点核淀粉酶RIPK3等,其质谱图下面的图图甲中。

04、好产品优缺点

1.诸多质控

金融业化特男人电极孵育、SDS-PAGE检则、WB安全验证、模板有关性探讨等多多位检则,抓好好项目后果耐用性。

2.高能力质谱器材软件

在Orbitrap Astral全新几代高甄别质谱仪作明佛母心咒下,达成衣康硝化作用体现位点及蛋白质签定新的深度,转向科学技术钻研新察觉。

3.全工作流程站台式服務

来源于拜谱海洋生物进一步优化的调查工作平台,可展示“细胞核养成→探头孵育→WB测量→玄妙度衣康硝化作用遮盖测量→属于生信深入分析→特定的位点PRM证实”全方法保障,省时省劲、方便更省心省事。

05、概述游戏内容(区域)

06、拜谱生物走向

PART 2、论文资料每日分享

专著一

日语微信标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

繁体中文文章标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

科学研究文章:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

医学文献二

英文翻译标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名副标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

学习网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物衍生产品理念

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备有较可以的底物根据水平,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康酸性反应遮盖组实测值统计资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用绘制(一下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

看做TCA循环法中的上面分解细胞代谢率物,衣康酸调结分解细胞代谢率、抗体和慢性发炎间的彼此帮助,为冶疗抗体慢性发炎性慢性病给予了用于冶疗方案。衣康酸组成部分中的亲电性α,β-不饱合羧酸组成部分能对球核苷酸上的吸附性半胱氨酸残基去烷基化体现(迈克尔加持发生反应),此种反译后体现被称作“衣康酸体现(itaconation)”,借以不良影响球核苷酸工作,管控抗体回复和分解细胞代谢率渠道,为很多慢性病食用的药物研制给予新一个构想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应掩盖核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物临床医学绝对化按量靶点排泄组(QMT1000)或电量新陈代谢率靶点新陈代谢率组成品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

选取文献综述

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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